El
Servicio de Secuenciación y Genómica Funcional, gracias a los fondos obtenidos en las convocatorias de infraestructuras FEDER 2010 y 2014, ha adquirido recientemente una
Plataforma de secuenciación masiva Ion Torrent (Life Technologies) compuesta por los secuenciadores
Ion PGM e
Ion S5XL y los equipos de preparación de librerías y moldes
One Touch 2 e
Ion Chef, y una
Plataforma de dispensación de líquidos Freedom Evo 100 (Tecan), con las que ha aumentado notablemente su cartera de servicios.
La principal ventaja de la plataforma de secuenciación masiva frente al secuenciador capilar ya presente en el Servicio es la escala de trabajo y la versatilidad. Se pasa de procesar 24 secuencias de una longitud máxima de 900 pb en 2 horas a poder alcanzar, con la misma dotación de personal técnico, una productividad máxima de 80 millones de lecturas por experimento, generando hasta 15Gb de datos de alta calidad en un periodo de tiempo máximo de 65 horas y a un coste razonable, pudiéndose llevar a cabo ensayos de resecuenciación de genomas completos, resecuenciación selectiva, secuenciación de novo de genomas de microorganismos, secuenciación de ARNmensajero y ARNpequeño, secuenciación de transcriptoma dirigido, secuenciación de transcriptoma completo, secuenciación de exomas, secuenciación de ADN modificado con bisulfito para estudios de perfiles de metilación, secuenciación ChIP-Seq para estudios de interacciones DNA-proteína y RNA-proteína, secuenciación CNV-Seq para medición de la variación del número de copia, metagenómica (secuenciación de ARNr 16S)…. Por su parte, la plataforma de dispensación de líquidos es un sistema robotizado para la preparación automática y en cualquier formato (placas de 96 o 384 y tubos) de pre-PCR, pre-qPCR y librerías para las distintas aplicaciones de secuenciación masiva.
La adquisición de estos equipos asegura la calidad y competitividad del servicio ofrecido al permitir responder a las nuevas necesidades que, respecto a la tecnología de Secuenciación, han surgido entre los grupos de investigación de áreas muy diversas en nuestro entorno.
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